Endometrial polip ve endometrial kanser olgularında long non coding RNA ekspresyonlarının karşılaştırılması

Abstract

Amaç: Bu çalışmanın amacı endometrial polip ve endometrial kanser dokularında son literatür verilerine bakarak seçtiğimiz dört farklı long non- coding RNA (XIST, UCA1, MALAT1 ve ANRIL) ekspresyonlarının sağlıklı endometrium ile karşılaştırarak benign-malign ayrımında tanısal ve prognostik değerlerini araştırmaktır. Gereç ve Yöntem: Ağustos 2021–Nisan 2024 döneminde anormal uterin kanama nedeniyle biyopsi yapılan ve parafin blokları temin edilen 150 kadın çalışmaya alındı (Endometrial polip = 50 hasta, endometrial kanser = 50 hasta, kontrol = 50 hasta). RNA’lar EcoSpin FFPE Total RNA kiti ile izole edildi, OneScript Plus kitiyle cDNA’ya çevrildi. XIST, MALAT1, UCA1 ve ANRIL ekspresyonları SYBR Green qRT-PCR ile, U6 snRNA referans alınarak 2^-ΔΔCt yöntemiyle kantifiye edildi. Gruplar Student’s t-test ile karşılaştırıldı; çoklu testler için False Discovery Rate düzeltmesi uygulandı. p<0,01 ve ±2 kat değişim anlamlı kabul edildi. Bulgular: Ekspresyon seviyeleri kontrol grubuna kıyasla endometrial polip dokularında ANRIL 2,17 kat, MALAT1 3,10 kat, UCA1 4,52 kat ve XIST 4,99 kat azaldı (tümü p<0,001). Endometrial kanser dokularında azalma daha belirgindi; ANRIL 21,53 kat, MALAT1 3,13 kat, UCA1 4,82 kat ve XIST 14,98 kat (tümü p<0,001). Demografik veriler gruplar arasında homojendi. Sonuç: XIST, MALAT1, UCA1 ve ANRIL ekspresyonları EK dokularında daha fazla olmak üzere her iki grupta da kontrol grubuna göre anlamlı derecede azalmıştır. Bu dört lncRNA, endometrial lezyonların benign-malign ayrımında potansiyel tanısal biyobelirteçlerdir ve özellikle XIST ile ANRIL, malign progresyonun moleküler göstergesi olabilir. Bulgular, lncRNA’ların, premalign poliplerin erken saptanması ve EK için kişiselleştirilmiş izlem-tedavi stratejilerinin geliştirilmesinde klinik kullanıma girmesine zemin hazırlayabilir.Aim: The aim of this study is to investigate the diagnostic and prognostic values of four different long non-coding RNAs (XIST, UCA1, MALAT1 and ANRIL) expressions that we selected based on the latest literature data in endometrial polyp and endometrial cancer tissues, in the distinction between benign and malignant, by comparing them with healthy endometrium. Materials & Method: 150 women who underwent biopsy due to abnormal uterine bleeding and whose paraffin blocks were obtained between August 2021 and April 2024 were included in the study (Endometrial polyp = 50 patients, endometrial cancer = 50 patients, control = 50 patients). RNAs were isolated with the EcoSpin FFPE Total RNA kit and converted to cDNA with the OneScript Plus kit. XIST, MALAT1, UCA1 and ANRIL expressions were quantified with SYBR Green qRT-PCR using the 2^-ΔΔCt method using U6 snRNA as a reference. The groups were compared with Student’s t-test; False Discovery Rate correction was applied for multiple tests. p<0.01 and ±2-fold change were considered significant. Results: The expression levels of ANRIL decreased 2.17-fold, MALAT1 3.10-fold, UCA1 4.52-fold and XIST 4.99-fold in endometrial polyp tissues compared to the control group (all p<0.001). The decrease was more pronounced in endometrial cancer tissues; ANRIL 21.53-fold, MALAT1 3.13-fold, UCA1 4.82-fold and XIST 14.98-fold (all p<0.001). Demographic data were homogeneous between the groups.