Comparison of microbiological methods for the diagnosis of urinary tract infections

Abstract

Objective: Urinary tract infections are the most frequent bacterial infections in adults and may be seen in all age groups and both genders. In this study, urine culture which is the gold standard diagnostic method of urinary tract infections is compared with Gram stain, Thoma counting chamber, nitrite reductase test and leukocyte esterase (LE) test in efficiency for rapid and reliable diagnosis of urinary tract infection. Methods: This study was performed in our laboratory between May 2010 and November 2010. 658 urine samples of patients with urinary tract infection symptoms from outpatient and inpatient clinics were included in the study. Urine samples were examined by Gram stain, leukocyte count in Thoma chamber, nitrit test and LE test, and cultured. Microorganisms were identified using conventional methods and API® (bioMeriéux, Fransa) identification systems. Results: Cultures were found positive in 137 (20.8%) samples and 143 (21.7%) cultures were evaluated as contamination. For Gram stain, the results for sensitivity, specificity, false positivity and false negativity were 82.2%, 96.8%, 3.2%, and 17.8%, respectively. For Thoma counting chamber, the results were 78.8%, 81.5%, 18.5%, 21.2%, respectively. For nitrite reductase test they were 40.1%, 95.8%, 4.2%, 59.9%; and for LE test, they were 88.1%, 34.1%, 65.9%, 11.9%, respectively. Conclusions: Gram stain was found to be the most suitable method for rapid diagnosis of urinary tract infections compared to other diagnostic methods. False positive and false negative rates were low with very high sensitivity and specificity rates, besides ease of application.

Amaç: Üriner sistem infeksiyonları (ÜSİ), yetişkinlerde bakteriyel infeksiyonların en sık görülen sebebi olup, her iki cinste ve tüm yaş gruplarında görülebilmektedir. Bu çalışmada, ÜSİ’nin hızlı ve güvenilir tanısında, Gram boyaması, Thoma sayma kamarasında lökosit sayımı, nitrit testi ve lökosit esteraz (LE) testinin etkinliği, ÜSİ tanısında altın standard olan idrar kültürüyle karşılaştırılmıştır. Yöntemler: Mayıs-Kasım 2010 arasında polikliniklerden ya da yatan hastalardan gönderilen 658 idrar örneği incelenmiştir. Klinik bilgilerine ulaşılan, ÜSİ’yi düşündüren semptomları bulunan ve yaş aralığı 0-106 olan hastalar çalışmaya dahil edilmiştir. İdrar örnekleri, Gram boyaması, Thoma sayma kamarasında lökosit sayımı, nitrit testi ve LE testiyle incelenerek kültürleri yapılmıştır. Üreyen mikroorganizmalar klasik yöntemler ve API® (bioMeriéux, Fransa) kullanılarak saptanmıştır. Bulgular: Örneklerin 137 (%20.8)’sinde üreme tespit edilmiş, 143 (%21.7)’ü kontaminasyon olarak değerlendirilmiştir. Gram boyamasının duyarlılığı %82.2, özgüllüğü %96.8, yalancı pozitifliği %3.2, yalancı negatifliği %17.8 olarak saptanmış olup, bu oranlar sırasıyla Thoma sayma kamarasında lökosit sayımı için, %78.8, %81.5, %18.5, %21.2; nitrit testi için, %40.1, %95.8, %4.2, %59.9; LE testi için, %88.1, %34.1, %65.9, %11.9 olarak tespit edilmiştir. Sonuçlar: Gram boyamasının, duyarlılık ve özgüllüğünün oldukça yüksek, yalancı pozitif ve yalancı negatifliklerinin diğer yöntemlere oranla düşük ve uygulanabilirliğinin kolay olması nedeniyle, ÜSİ’nin hızlı tanısında kullanılabilecek en uygun yöntem olduğu sonucuna varılmıştır.